Дипломная работа на тему: Изучение микробиома рыб

План работы:

ВВЕДЕНИЕ 3
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 5
1.1. Современные знания о кишечной микробиоте рыб 5
1.1.1. Отбор проб микробиома 5
1.1.2. Культуральные системы для характеристики микробиома 6
1.1.3. Технологии анализа микробиома 8
1.1.3.1. Секвенирование нуклеотидов 8
1.1.3.2. Другие культурально-независимые методы молекулярного профилирования 10
1.1.4. Проведение метагеномного анализа желудочно-кишечного тракта рыб 11
1.2. Данные о составе микробиоты 15
1.2.1. Специфичные представители микробиоты - вирусы 18
1.2.2. Специфичные представители микробиоты - грибы 18
1.3. Роль микробиоты, ассоциированной с ЖКТ рыб 20
1.3.1. Питание / пищеварение / метаболизм 20
1.3.2. Стрессовая реакция 21
1.3.3. Воспроизводство / развитие 22
1.3.4. Иммунный ответ 24
1.4. Факторы, оказывающие влияние на кишечную микробиоту рыб 24
1.4.1. Факторы окружающей среды 25
1.4.2. Внутренние факторы, специфичные для хозяина 26
1.4.2.1. Возрастная/половая зрелость 27
1.4.2.2. Особенности питания 28
1.5. Биоразнообразие дельты реки Печора 29
ГЛАВА 2. ОБЪЕКТ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ 31
2.1. Характеристика объекта исследования и отбор образцов 31
2.2. Выделение ДНК 32
2.3. Групп-специфичная ПЦР 34
2.4. Секвенирование 36
ГЛАВА 3. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ 38
3.1. Особенности ихтиофауны арктического региона на примеры дельты реки Печора 38
3.2. Выделение ДНК 40
3.3. Амплификация заданного участка методом ПЦР 42
3.4. Сравнение данных профилирования карпообразных 44
ЗАКЛЮЧЕНИЕ 48
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 50
ПРИЛОЖЕНИЕ 61