Дипломная работа на тему: Сравнительный анализ структурно-функциональных особенностей целлюлаз с разными температурным оптимумом действия

План работы:

ВВЕДЕНИЕ 3
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 6
1.1. Целлюлазы: общая характеристика 6
1.1.1. Классификация целлюлаз 6
1.1.2. Строение целлюлаз 8
1.2. Механизм действия целлюлазного комплекса 9
1.3. Особенности целлюлаз термофильных и психрофильных организмов 10
1.4. Организмы - продуценты целлюлаз 12
1.5. Прикладное значение целлюлаз 14
1.6. Методы, используемые при сравнительном анализе белков 18
1.6.1. Выравнивание последовательностей 18
1.6.2. Методы предсказания белковых доменов 19
ГЛАВА 2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ 24
2.1. Объекты исследования 24
2.2. Методы исследования 24
2.2.1. Составление и оптимизация выборок аминокислотных последовательностей эндоглюканаз 24
2.2.2. Выделение доменной структуры белков 24
2.2.3. Множественное выравнивание аминокислотных последовательностей эндоглюканаз 24
2.2.4. Построение дендрограмм с использованием кластерного анализа 25
2.2.5. Попарное выравнивание структур и последовательностей эндоглюканаз 25
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 26
3.1. Составление и оптимизация выборок аминокислотных последовательностей эндоглюканаз 26
3.2. Результаты глобального выравнивания и построения дендрограммы с использованием кластерного анализа 26
3.3. Выделение доменной структуры белков 28
3.4. Выравнивание аминокислотных последовательностей эндоглюканаз по эталонной последовательности 30
3.5. Построение дендрограмм для последовательностей грибов и бактерий 30
3.6. Выравнивание последовательностей эндоглюканаз по целлюлозосвязывающему домену 32
3.7. Построение дендрограмм по целлюлозосвязывающему домену эндоглюканаз выборки 33
3.8. Попарное выравнивание структур эндоглюканаз 34
ВЫВОДЫ 38
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 39
ПРИЛОЖЕНИЕ 43