Дипломная работа на тему: Филогеографическая структура и ДНК-штрихкодирование Rhaponticum carthamoides (Willd.) Iljin

План работы:

ВВЕДЕНИЕ 3
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 6
1.1. Ботанико-экологическая характеристика и географическое распространение Rhaponticum carthamoides (Willd.) Iljin 6
1.1.1. Состав и морфолого-экологическая характеристика видового комплекса Rh. carthamoides sensu lato 6
1.1.2. Эндемизм, географическое распространение Rh. сarthamoides и принятые меры по его охране 8
1.1.3. Кариологическая характеристика Rh. сarthamoides 10
1.1.4. Молекулярная идентификация и ДНК-штрихкодирование растений 11
1.1.5. Исследования Rh. carthamoides с применением молекулярно-генетических методов анализа 12
1.2. Хозяйственное значение Rh. carthamoides 13
1.2.1. Использование Rh. carthamoides в качестве лекарственного сырья и препараты на его основе 13
1.2.2. Другие продукты с использованием сырья Rh. carthamoides 14
ГЛАВА 2. ОБЪЕКТ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ 17
2.1. Сбор и фиксация материала 17
2.2. Выделение ДНК 18
2.3. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) 19
2.4. Электрофорез в агарозном геле, выделение и очистка фрагментов ДНК 21
2.5. Лигирование в плазмидный вектор 22
2.6. Клонирование фрагментов ДНК в клетках Escherichia coli. Выделение плазмидной ДНК 22
2.7. Секвенирование ДНК по методу Сэнгера и капиллярный электрофорез 23
2.8. Обработка и анализ результатов 24
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 25
3.1. Количественный и качественный анализ суммарной ДНК 25
3.2. Анализ нуклеотидных последовательностей региона ITS1-ITS2 у Rh. сarthamoides 26
3.2.1. Определение условий амплификации ITS1-ITS2 26
3.2.2. Определение нуклеотидных последовательностей и характеристика амплифицированного региона ITS1-ITS2 27
3.2.3. Филогенетический анализ с использованием последовательностей ITS1-ITS228
3.3. Анализ нуклеотидных последовательностей фрагмента гена rbcL у Rh. сarthamoides 30
3.3.1. Определение условий амплификации rbcL 30
3.3.2. Определение нуклеотидных последовательностей и характеристика амплифицированного фрагмента rbcL 30
3.3.3. Филогенетический анализ с использованием последовательностей rbcL 32
3.4. Анализ нуклеотидных последовательностей фрагмента гена matK у Rh. сarthamoides 34
3.4.1. Определение условий амплификации matK 34
3.4.2. Определение нуклеотидных последовательностей и характеристика амплифицированного фрагмента matK 35
3.4.3. Филогенетический анализ с использованием последовательностей matK 36
3.5. Анализ нуклеотидных последовательностей региона, включающего фрагмент гена trnL и межгенный спейсер trnL-trnF, у Rh. сarthamoides 38
3.5.1. Определение условий амплификации trnL и trnL-trnF 38
3.5.2. Определение нуклеотидных последовательностей и характеристика амплифицированного фрагмента trnL и trnL-trnF 38
3.5.3. Филогенетический анализ видов с использованием последовательностей trnL и trnL-trnF 39
3.6. Анализ нуклеотидных последовательностей межгенного спейсера trnH-psbA у Rh. сarthamoides 42
3.6.1. Определение условий амплификации trnH-psbA 42
3.6.2. Определение нуклеотидных последовательностей и характеристика амплифицированного фрагмента trnH-psbA 42
3.6.3. Филогенетический анализ с использованием последовательностей trnH-psbA 43
ВЫВОДЫ 45
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 47