Дипломная работа на тему: Исследование филогеографии и эволюционных взаимоотношений популяций Anemone baicalensis Turcz. с использованием маркеров ядерной и хлоропластной ДНК

План работы:

ВВЕДЕНИЕ 3
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 6
1.1. Характеристика видового комплекса Anemone baicalensis Turcz 6
1.1.1. Систематика, ботанико-экологическая характеристика и географическое распространение Anemone baicalensis s.l 6
1.1.2. Проблема установления систематического статуса комплекса видов A. baicalensis aggr. и их филогенетических отношений 10
1.1.3. Карилогическая характеристика видов A. baicalensis aggr. и географическое распространение различных хромосомных рас 11
1.2. Молекулярно-генетические маркеры в филогенетических и популяционных исследованиях высших растений 12
1.2.1. Обзор и классификация молекулярно-генетических маркеров 12
1.2.2. ITS регион 14
1.2.3. Маркеры хлоропластной ДНК 16
ГЛАВА 2. ОБЪЕКТ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ 20
2.1. Сбор и фиксация материала 20
2.2. Выделение ДНК 20
2.3. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) 21
2.4. Электрофорез в агарозном геле, выделение и очистка фрагментов ДНК 23
2.5. Лигировавание в плазмидный вектор 23
2.6. Клонирование фрагментов ДНК в клетках Escherichia coli. Выделение плазмидной ДНК 23
2.7. Секвенирование ДНК по методу Сэнгера и капиллярный электрофорез 24
2.8. Обработка и анализ результатов 25
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ 25
3.1. Анализ нуклеотидных последовательностей ITS1-ITS2 региона у Anemone baicalensis s.l 25
3.1.1. Определение условий амплификации 25
3.1.2. Определение нуклеотидных последовательностей ITS1-ITS2 региона и его характеристика 27
3.1.3. Полиморфизм ITS1-ITS2 региона у Anemone baicalensis s.l 29
3.2. Анализ нуклеотидных последовательностей trnL-trnF региона у А. baicalensis s.l 34
3.2.1. Определение условий амплификации 34
3.2.2. Определение нуклеотидных последовательностей и характеристика региона 34
3.2.3. Полиморфизм trnL-trnF региона у A. baicalensis s.l 36
3.3. Анализ нуклеотидных последовательностей atpB-rcbL региона у видов А. baicalensis aggr 38
3.3.1. Определение условий амплификации 38
3.3.2. Определение нуклеотидных последовательностей и характеристика региона 39
3.3.3. Полиморфизм atpB-rcbL региона у A. baicalensis s.l 42
3.4. Обсуждение результатов 44
ВЫВОДЫ 47
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 48