Дипломная работа на тему: Анализ биологических взаимоотношений с помощью геномных данных GENBANK

План работы:

ВВЕДЕНИЕ 3
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 7
1.1. Биоинформационные ресурсы как основа современных генетических исследований 7
1.1.1. Эра геномики и роль публичных баз данных 7
1.1.2. Типы данных, доступных в GenBank, и их применение 11
1.2. Алгоритмы и программное обеспечение для анализа данных из GenBank 14
1.2.1. Этапы работы с генетическими последовательностями 14
1.2.2. Методы популяционно-генетического анализа 16
1.2.3. Методы филогенетического анализа 18
1.3. Применение анализа данных из GenBank на примере Acipenser ruthenus 20
1.3.1. Обоснование выбора стерляди в качестве модельного объекта 20
1.3.2. Примеры исследовательских задач, решаемых с помощью GenBank 21
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ 26
ГЛАВА 3. ПРИМЕНЕНИЕ БАЗЫ ДАННЫХ GENBANK ДЛЯ АНАЛИЗА ВЗАИМООТНОШЕНИЙ МЕЖДУ РАЗЛИЧНЫМИ ВИДАМИ ОРГАНИЗМОВ 30
3.1. Сравнительный анализ митохондриальных геномов стерляди (Acipenser ruthenus) из рек Волга и Дунай на примере данных из GenBank 30
3.2. Общие параметры митохондриальных геномов 32
3.3. Показатели генетического разнообразия 33
3.4. Распределение гаплотипов и популяционная структура 35
3.5. Генетическая дифференциация между популяциями 37
ЗАКЛЮЧЕНИЕ 41
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 42